在此次批準設立的國家公園中，東北虎豹國家公園跨吉林、黑龍江兩省，大熊貓國家公園則地跨四川、陜西、甘肅3省?？梢哉f，跨越不同行政區劃是國家公園較為鮮明的一個特點，也是國家公園機制體制創新的重要嘗試。然而，這同時也帶來了一個難題：跨區域的有效管理該如何實現？

　　“國家公園是一個多樣的生態系統單元，應按照生態系統完整性、原真性保護的要求，制定專門的法律，而各行政區的政府則應該依法管理，并建立跨行政區管理機構和協調機制。” 北京林業大學教授雷光春告訴記者。

　　對于生活在國家公園的野生動物而言，它們的活動并不受行政邊界的限制。在中央的統一部署下，近幾年各地有效聯動，整合了數十個各級各類自然保護地，跨省的國家公園相繼建立。而省域也不再是動物生存活動的邊界，它們可以更自由地交流繁衍，這讓東北虎豹等一些珍稀野生動物的數量都有了增加。

　　以橫跨福建和江西兩省的武夷山國家公園為例，其整合了武夷山國家級自然保護區、武夷山國家級風景名勝區、江西武夷山國家級自然保護區以及江西鵝湖山國家森林公園等自然保護地。這些自然保護區為試點建設和跨省區協調管理打下了良好的基礎。

　　“我認為最核心的工作還是法制的建立。”雷光春解釋道，“不管是省也好還是縣也好，都按照《國家公園法》來開展保護工作，通過法制讓不同省區的生態系統保護工作有明確的同一把尺子，也提供同樣的標準”。此外，他建議，建立協調委員會和利益相關方合作委員會，實現有效的協調管理。“下一步再根據實際情況對相關條例進行完善。”雷光春補充道。