青稞基因組圖譜全球首發(fā) 有助于作物適應(yīng)性機(jī)制研究
近日,全球首個(gè)青稞基因組圖譜正式繪制成功,其研究成果在線發(fā)表在國(guó)際著名期刊PNAS雜志上,該研究對(duì)青稞的西藏地方品種LasaGoumang進(jìn)行了全基因組測(cè)序及圖譜繪制,有助于高原作物的適應(yīng)性機(jī)制研究。
研究構(gòu)建圖譜占青稞基因組的87%
青稞經(jīng)過(guò)藏族人民長(zhǎng)達(dá)3500~4000年的馴化栽培,已經(jīng)完全適應(yīng)了極端的高原氣候,成了藏族人民的主食。據(jù)悉,西藏地區(qū)的青稞種植面積占西藏耕地面積的70%。西藏自治區(qū)農(nóng)牧科學(xué)院、西藏自治區(qū)大麥和牦牛培育重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、中國(guó)科學(xué)院、深圳華大基因研究院及華大科技等在內(nèi)的眾多研究機(jī)構(gòu),于2012年正式啟動(dòng)了青稞基因組研究合作項(xiàng)目,以揭示青稞的高原適應(yīng)性機(jī)制,解讀其起源、馴化及栽培選育過(guò)程。
1月13日公布的全球首個(gè)青稞基因組圖譜,對(duì)青稞的西藏地方品種LasaGoumang進(jìn)行了全基因組測(cè)序及圖譜繪制,獲得了基因圖譜,共包含36151個(gè)蛋白編碼基因。據(jù)估計(jì),青稞基因組大小約為4.5Gb,本次研究所構(gòu)建的青稞基因組圖譜大小為3.89Gb,共占青稞基因組的87%。
有助于改良高原類植物
對(duì)于人們最感興趣的青稞的高原適應(yīng)性機(jī)制問(wèn)題,此次研究人員也做了專門研究,并發(fā)現(xiàn)了一系列在青稞品種中發(fā)生了正向選擇的基因家族。如,調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄過(guò)程的基因家族,激活轉(zhuǎn)錄因子的基因家庭,防御反應(yīng)相關(guān)的基因家庭等都得到了大量的擴(kuò)張,這些基因家族的擴(kuò)張使得青稞在面對(duì)高原的惡劣環(huán)境時(shí)具有更大的調(diào)節(jié)彈性,從而具有更好的適應(yīng)性。
華大基因該項(xiàng)目負(fù)責(zé)人趙山岑表示,作為麥族的重要一員,青稞基因組的發(fā)表,不但幫助人們更好地理解大麥類作物的不同馴化途徑,同時(shí)也使得我們能夠結(jié)合大麥、小麥及其祖先品種一窺麥族的進(jìn)化歷史,“而青稞在耐寒缺氧等極端環(huán)境的適應(yīng)性問(wèn)題,更好地為我們進(jìn)行高原類作物的改良指明了方向,有助于解決民生中的糧食問(wèn)題。”
編輯:guoai
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