還需注意的是，與大江大河相比，湖泊的生態比較脆弱，污染、破壞比較容易，急需研究出一套保護、治理和修復等技術和制度。

　　比如位于湖北省鄂州市的梁子湖是我國東部地區唯一出現一類水質，常年整體保持二類水質的大中型湖泊。但是2010年的罕見大洪水，致使80％的水生植物死亡，水質急劇惡化。經過一年多努力，水生植被部分恢復，梁子湖整體水質回到了三類。不過，受2011年旱澇交替氣候影響，岸邊剛剛萌發生機的濕地又遭到一定程度的破壞，梁子湖生態環境依然脆弱。

　　《湖泊生態環境保護試點管理辦法》（簡稱《辦法》）的第一條明確提出，“根據《中華人民共和國水污染防治法》，按照黨中央、國務院讓江河湖泊休養生息的戰略部署，為保護湖泊生態環境，改善湖泊水質，避免走‘先污染、后治理’的老路，財政部、環境保護部決定開展湖泊生態環境保護試點工作，建立優質生態湖泊保護機制。”

　　《辦法》要求，湖泊生態環境保護投入以地方政府為主，中央財政按照適當比例予以補助，具體根據試點工作進度、年度績效目標等分年安排；試點期限為3—5年，試點期滿或試點績效目標完成后，根據試點工作總體績效評價情況獎優罰劣。

　　《辦法》鼓勵探索“一湖一策”的湖泊生態環境保護方式，引導建立湖泊生態環境保護長效機制；湖泊生態環境保護試點工作由省級政府負總責，湖泊所在市縣政府具體負責保護工程項目建設和相關工作組織實施。財政部、環保部與省級政府簽署責任協議，確保試點工作績效目標明確，責任到省，取得實效；試點工作還實行“擇優保護，集中支持，分批安排，鼓勵先進，注重績效”的辦法，向社會公開，接受社會監督。

　　找出湖泊生態保護的問題或措施

　　《辦法》規定“省級政府在開展湖泊生態安全調查與評估基礎上組織編寫湖泊生態環境保護試點實施方案。實施方案要全面深入分析試點湖泊生態安全影響因素，提出試點績效目標及具體保護措施。試點績效目標包括總體績效目標、年度績效目標和具體項目績效目標。保護措施要針對湖泊生態環境面臨的問題，提出針對性、可行的技術路線，并列出項目清單、項目建設進度、項目績效目標和資金需求。”

　　根據《湖泊生態環境保護試點實施方案編寫提綱》要求，在“問題診斷”方面，將全面深入分析湖泊生態環境保護面臨的主要問題或潛在風險。要根據湖泊生態環境狀況的歷史演變過程及經濟社會發展方向等，量化分析不同問題與湖泊生態環境安全的相關度，找出主要矛盾和癥結問題。

　　“具體保護措施”要求針對問題診斷及試點績效目標，確定科學、合理的湖泊生態環境保護技術路線，并明確具體保護措施。湖泊生態環境保護技術路線和具體保護措施要與問題診斷環環相扣，要能夠切實推進試點績效目標實現。產業結構調整類保護措施要建立長效機制，確保保護措施落實后不反復；建設項目類保護措施要有相應的運營保障措施，切實保證項目建成后能夠運行等。

　　以洱海為例，環保部部長周生賢就曾總結說，“洱海經驗”包括“循法自然、科學規劃、全面控污、行政問責、全民參與”。在洱海邊記者看到，湖邊三個水池長滿“苔蘚”、種植著美人蕉和蘆葦等挺水植物，沿湖居民的生活、農業生產用水經過三級沉淀，挺水植物吸收富營養化物質后，再排入洱海。大理州政府提出“像保護眼睛一樣保護洱海”，在才村碼頭建立了南北長約500米、東西縱深約200米、總面積約10萬平方米的才村生態修復帶，成為洱海減污的“睫毛”。

　　羅時江、永安江和彌苴河“二江一河”入湖水量占洱海來水的70%，污染物占65%，攔住這“二江一河”的污染物，將極大改善洱海的水質。大理市規劃建設面積達1300畝的羅時江河口生態濕地系統。這道屏障通過植物吸附、梯級凈化，有效地減少了進入洱海的氮磷總量，減輕了洱海富營養化水平。

　　此外，總面積12334.98畝的灘地實施退田還林、退塘還湖、退房還濕地，半年全湖封湖，禁漁。大理的這些舉措，直接涉及湖內2.5萬以捕魚為生的漁民。他們放棄了祖祖輩輩沿襲下來的生活方式，只為保護洱海……